两个学校都很优秀，各有千秋。以下是对两个化学系的详细比较。

首先，师资力量方面，清华化学系和北大化学系都具有雄厚的师资力量。清华化学系拥有一批在国内外享有盛誉的学者，如江雷、张希、鲍哲楠等，他们在各自的研究领域都做出了杰出贡献。北大化学系同样云集了一批优秀的学者，如江林、刘忠范、高松等，他们在国内外学术界都享有很高的声誉。

其次，科研水平方面，清华化学系和北大化学系都在国际上取得了很高的学术地位。根据2022年QS世界大学化学学科排名，清华大学排名17位，北京大学则排在第18位。在具体的科研成果方面，两个化学系都取得了许多重要的成就，如清华化学系在纳米材料、绿色化学等领域取得了显著成果，而北大化学系在化学生物学、超分子化学等领域也取得了丰硕的成果。

再次，学术声誉方面，清华化学系和北大化学系都具有很高的学术声誉。清华大学和北京大学都被公认为中国最顶尖的学府之一，而两所大学的化学系也都在国际学术界享有很高的声誉。两个化学系的毕业生都受到国内外顶尖科研机构和企业的青睐，具有很高的就业竞争力。

总的来说，清华化学系和北大化学系都是中国乃至世界化学研究的重要力量。两个化学系在师资力量、科研水平、学术声誉等方面都表现优异，难以简单地说哪个更好。选择哪个化学系主要应该根据个人的兴趣、发展方向和未来规划来做出决定。